TP : mutations et polymorphisme : matériel et corrigé
(Stabilité et variabilité des génomes et) évolution
TP |
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Logiciel ClustalX
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Informations
Comparaison des allèles ib et iØ avec ia
allèle | ADN | traduction |
ib | C523 → G G700 → A C793 → A G800 → C |
CGC175 → GGC, Arg175 → Gly, substitution faux sens GGC234 → AGC, Gly234 → Ser, substitution faux sens CTG265 → ATG, Leu265 → Met, substitution faux sens GGG267 → GCG, Gly267 → Ala, substitution faux sens |
iØ | -G258 | délétion décalante 87 → 117 puis TAA117 (stop) |
Le test de Guthrie (du nom d'un médecin américain) détecte la concentration en phénylalanine dans le sang par la croissance d'une culture bactérienne.
Les mutations de la PAH prises en exemple (d'après Barrère)
mutation | ADN | traduction | Phenylcétonurie chez l'homozygote |
phe1 (mut55) | -T165 | délétion décalante, TTT55...TAA60 (stop) | Forte |
phe2 (mut95) | -ATC283, 284, 285 | délétion non décalante, -Ile95 | Légère |
phe4 (mut158) | G473 → A | CGG158 → CAG, Arg158 → Gln, substitution faux sens | Modérée |
phe7 (mut243) | C727 → T | CGA243 → TGA, substitution non sens | Forte |
Références
Bouyssou Y. Salamé N. 1997. Anagène, analyse de séquences nucléiques et protéiques. Paris, CNDP.
Barrère J.. Le phénotype phénylcétonurique. www.inrp.fr/Acces/biotic/gpe/dossiers/phenylcetonurie/accueil.htm
Barrère J.. Le phénotype phénylcétonurique. www.inrp.fr/Acces/biotic/gpe/dossiers/phenylcetonurie/accueil.htm